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NVIDIA Tesla GPU實現1000美元基因組定序解碼

本文作者:NVIDIA       點擊: 2012-11-07 15:50
前言:
生命科技公司全新Ion Proton定序儀讓全球科學家和藥物研究人員廣泛採用基因組定序

2012117--生命科技公司 (Life Technologies Corporation) 為其 Ion Proton™ 定序儀系統加入 NVIDIA® Tesla® GPU 加速器,加快基因組定序分析 (計算出 DNA 鹼基對) 的速度高達 16 倍以上。可大幅降低整個人類基因組定序之成本; 10 年前人類基因組解碼約需 10 億美元,而在不久的將來 1,000 美元即可實現。

 

生命科技公司旗下離子流公司 (Ion Torrent) 軟體研發副總 Alan Williams 表示:「 Ion Proton 定序儀擁有 GPU 加速和其他先進的功能,為全球每個實驗室提供可以快速運用人類基因組定序的簡易方法,重要的是可讓人類基因組解碼不再是鉅額的 IT 投資。全力推動基因組定序的普及使用,我們期待在生命科學領域和臨床研究有另一番的創新景象。」

 

生命科技公司的 Ion Personal Genome Machine® (PGM) Sequencer 在提升基因組定序輸出量、準確度和讀長 (read-length) 方面都有長足的進展,而該系統更使用了 GPU 加速來大幅增進其重要分析的速度。 Ion Proton 定序儀系統的先進技術則以 PGM 的先進技術為基礎,以其優異的分析速度率先為導致多人死亡的 2011 年德國大腸桿菌疫情解碼,找出致病原因。

 

Ion Proton 定序儀系統在效能、簡易使用度和價格上都樹立了全新標準,可讓研究人員使用單一平台即可將複雜的樣本定序變成基因組定序,而價格也只要輕量型基因組定序系統的五分之一,可為研究人員節省數十萬成本。

 

NVIDIA (輝達) 公司 Tesla 加速運算事業部總經理 Sumit Gupta 表示:「各種生命科學應用運算已全面使用 GPU 加速功能,其讓科學研究的發現屢創佳績。 GPU 的應用全面加速了科學研究的發展速度,無論是基因組定序儀和基因定序分析,甚至到分子組成模型和放射診斷,都可從中受惠。」

 

關於NVIDIA Tesla GPU

NVIDIA Tesla GPU 是以 NVIDIA CUDA® 平行運算平台和編程模式為基礎的密集型平行運算加速器。 Tesla GPU 的設計始終以節能、高效能運算、計算型科學和超級運算為宗旨,相較於僅用 CPU 的運算架構,搭載了 Tesla GPU 的系統可為廣泛的科學和商業應用軟體帶來優異的效能和大幅的加速成效。

 

關於 NVIDIA (輝達)

NVIDIA (輝達) 公司在 1999 年發明了繪圖處理器 (GPU) 後,便讓全世界認識到電腦繪圖功能的威力;如今,其處理器啟動從智慧型手機超級電腦等廣泛的產品。NVIDIA (輝達) 的行動處理器,普遍應用於手機平板電腦以及車用資訊娛樂系統中。PC 遊戲玩家仰賴GPU,享受真正身歷其境的世界。專業人士利用GPU創造電影中精采的3D 繪圖和視覺效果,也設計出從高爾夫俱樂部到大型噴射客機等各種物件。而研究員運用 GPU ,可以透過高效能運算促進科學新領域的發展。 NVIDIA (輝達) 擁有超過 5,000 項已核發、認可或申請中之專利,其中包括現代運算技術基礎之設計與深入研究。

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